Die PCR-Methode

PCR

Die PCR ist eine Methode der Gentechnologie zur gezielten Vervielfältigung von DNA-Abschnitten.


Funktion

PCR ist die englische Kurzform für Polymerase Chain Reaction (auf deutsch: Polymerase-Kettenreaktion).

Sie ist eine Methode zur gezielten Vervielfältigung von DNA-Abschnitten in sehr kurzer Zeit. Das passiert mithilfe der Taq-Polymerase.

Die vervielfältigte DNA wird dann für weitere gentechnische Verfahren genutzt.

Zutaten

Um eine PCR durchzuführen brauchst du folgende Zutaten:

  • Einen DNA-Abschnitt
  • Nukleotide
  • Hochspezifische Primer (genau passend für die vorliegende DNA-Sequenz)
  • Hitzestabile DNA-Polymerase
  • Puffer (stabilisiert den pH-Wert für die Polymerase)
  • Magnesium-Ionen

Der ganze Prozess findet in einem Thermocycler statt. Dieser reguliert dann die Temperatur für jede Phase.

Ablauf

Schiebe die Knöpfe, um sie aktivieren zu können.

Die PCR findet in den folgenden 3 Phasen statt:

  • Denaturierung
  • Primerhybridisierung
  • Elongation

Die verschiedenen Phasen werden im Thermocycler durch die Regulierung der Temperatur eingeleitet.

Denaturierung

  • Erhitzen auf 94-96°C (20-30 Sek.)
  • Die Wasserstoffbrückenbindungen zwischen den komplementären Basen wird gebrochen
  • Der Doppelstrang wird in seine beiden Einzelstränge getrennt

Primerhybridisierung

  • Schnelles Abkühlen auf 50-65°C (20-40 Sek.)
  • Die genaue Temperatur hängt von der Primerlänge ab
  • Anlagerung der Primer an die Einzelstränge

Elongation

  • Erhitzen auf ca. 72°C
  • Die hitzestabile Taq-Polymerase beginnt mit der Verknüpfung der Nukleotide
  • Kontinuierliche Verknüpfung auf beiden Strängen (3´nach 5´ aus Sicht des Matrizenstrangs)
  • Die Dauer dieser Phase hängt von der DNA-Länge ab (30. Sek pro 500 Basenpaare)

Die einzelnen Phasen können dann beliebig oft wiederholt werden.

Ergebnis

In kürzester Zeit entstehen so zahlreiche Kopien der DNA.

Die Vervielfältigung der DNA-Stränge läuft exponentiell ab, weil letztlich aus jedem Strang ein Neuer entsteht.

Die Formel für die Anzahl der DNA-Doppelstränge nach jedem Zyklus (n) lautet also:

\text{Anzahl} = 2^\text{n}Anzahl=2n\text{Anzahl} = 2^\text{n}
Die DNA wird bei der PCR exponentiell vermehrt, weil aus jedem Doppelstrang zwei neue entstehen. Am Anfang hat man einen Doppelstrang. Nach dem ersten Zyklus hat man 2 Doppelstränge, nach dem zweiten Zyklus hat man 4 Doppelstränge und nach dem dritten hat man 8 Doppelstränge.

Vergleich zur DNA-Replikation

PCR

DNA-Replikation

DNA-Doppelstrang wird durch

Temperatur getrennt (94-96°C)

DNA Doppelstrang wird durch das

Enzym Helicase aufgetrennt

Künstliche DNA-Primer

gesetzt (längere Primer)

RNA-Primer durch Primase gesetzt

(kürzere Primer)

Verläuft an beiden Einzelsträngen kontinuierlich

(verläuft immer von 3' zu 5')

Verläuft am Leitstrang kontinuierlich

und am Folgestrang diskontinuierlich

Verwendung der hitzestabilen

Taq-Polymerase

Verwendung von DNA-Polymerase


Wusstest du schon?

Die PCR-Methode wurde in den 80er Jahren von einem DNA-Chemiker namens Kary Banks Mullis erfunden.

1993 erhielt er dafür den Nobelpreis in Chemie.

Mittlerweile ist die PCR-Methode aus den Laboren nicht mehr wegzudenken.

In der modernen Biologie wird sie in verschiedenen Bereichen eingesetzt:

  • Molekularforschung
  • Evolutionsforschung
  • Forensische Forschung (genetischer Fingerabdruck)
  • Medizinische Forschung und Untersuchung
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